Changeset 30927 in project


Ignore:
Timestamp:
05/26/14 08:49:42 (6 years ago)
Author:
Ivan Raikov
Message:

9ML-toolkit: final updates to IF models

Location:
release/4/9ML-toolkit/trunk/examples
Files:
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • release/4/9ML-toolkit/trunk/examples/AEIF_AL.xml

    r30924 r30927  
    1313    <Parameter name="V_peak"/>
    1414    <Parameter name="Delta"/>
     15    <Parameter name="theta"/>
    1516    <Parameter name="tau_w"/>
    1617    <Parameter name="tau_rp"/>
     
    3536
    3637          <TimeDerivative variable="V">
    37             <MathInline> (-g_L * (V - E_L) + g_L * Delta * exp ((V - V_T) / Delta) - W + Isyn) / C_m </MathInline>
     38            <MathInline> (- g_L * (V - E_L) + g_L * Delta * exp ((V - V_T) / Delta) - W + Isyn) / C_m </MathInline>
    3839
    3940          </TimeDerivative>
     
    4647
    4748            <Trigger>
    48               <MathInline>V &gt; (V_T + 4 * Delta) </MathInline>
     49              <MathInline>V &gt; theta </MathInline>
    4950            </Trigger>
    5051           
  • release/4/9ML-toolkit/trunk/examples/AEIF_UL.xml

    r30924 r30927  
    44    xsi:schemaLocation="http://nineml.incf.org/9ML/1.0/NineML_v0.3.xsd">
    55
    6     <Component name="TestAdEx">
     6    <Component name="TestAdEx1">
    77
    88        <Definition>
     
    1515          <Property>
    1616            <label>C_m</label>
    17             <value>0.281</value>
     17            <value>281.0</value>
    1818          </Property>
    1919
    2020          <Property>
    2121            <label>g_L</label>
    22             <value>0.3</value>
     22            <value>30.0</value>
    2323          </Property>
    2424
     
    3939
    4040          <Property>
     41            <label>theta</label>
     42            <value>-45.4</value>
     43          </Property>
     44
     45          <Property>
    4146            <label>V_R</label>
    42             <value>-65.0</value>
     47            <value>-70.6</value>
    4348          </Property>
    4449
     
    7580          <Initial>
    7681            <label>W</label>
    77             <value>0.1</value>
     82            <value>0.0</value>
    7883          </Initial>
    7984         
     
    9095          <Initial>
    9196            <label>Isyn</label>
    92             <value>10.0</value>
     97            <value>1000.0</value>
    9398          </Initial>
    9499
     
    105110        </properties>
    106111
    107         <ivp name="TestAdExBurst2">
    108           <timestep>0.001</timestep>
    109           <duration>500.0</duration>
     112        <ivp name="TestAdExRS">
     113          <timestep>1e-2</timestep>
     114          <duration>1000.0</duration>
    110115        </ivp>
    111116
    112117    </Component>
    113118
     119    <Component name="TestAdEx2">
     120
     121        <Definition>
     122            <link> AEIF_AL.xml </link>
     123            <language> NineML </language>
     124        </Definition>
     125
     126        <properties>
     127
     128          <Property>
     129            <label>C_m</label>
     130            <value>281.0</value>
     131          </Property>
     132
     133          <Property>
     134            <label>g_L</label>
     135            <value>30.0</value>
     136          </Property>
     137
     138          <Property>
     139            <label>E_L</label>
     140            <value>-70.6</value>
     141          </Property>
     142
     143          <Property>
     144            <label>Delta</label>
     145            <value>2.0</value>
     146          </Property>
     147
     148          <Property>
     149            <label>V_T</label>
     150            <value>-50.4</value>
     151          </Property>
     152
     153          <Property>
     154            <label>theta</label>
     155            <value>-45.4</value>
     156          </Property>
     157
     158          <Property>
     159            <label>V_R</label>
     160            <value>-45.4</value>
     161          </Property>
     162
     163          <Property>
     164            <label>V_peak</label>
     165            <value>20.0</value>
     166          </Property>
     167
     168          <Property>
     169            <label>tau_w</label>
     170            <value>20.0</value>
     171          </Property>
     172
     173          <Initial>
     174            <label>tau_rp</label>
     175            <value>0.25</value>
     176          </Initial>
     177
     178          <Property>
     179            <label>a</label>
     180            <value>4.0</value>
     181          </Property>
     182
     183          <Property>
     184            <label>b</label>
     185            <value>0.5</value>
     186          </Property>
     187
     188          <Initial>
     189            <label>V</label>
     190            <value>-65.0</value>
     191          </Initial>
     192
     193          <Initial>
     194            <label>W</label>
     195            <value>0.0</value>
     196          </Initial>
     197         
     198          <Initial>
     199            <label>spikeOutput</label>
     200            <value>false</value>
     201          </Initial>
     202
     203          <Initial>
     204            <label>refractoryEnd</label>
     205            <value>false</value>
     206          </Initial>
     207
     208          <Initial>
     209            <label>Isyn</label>
     210            <value>1000.0</value>
     211          </Initial>
     212
     213          <Initial>
     214            <label>tspike</label>
     215            <value>0.0</value>
     216          </Initial>
     217
     218          <Initial>
     219            <label>t_rpend</label>
     220            <value>0.0</value>
     221          </Initial>
     222
     223        </properties>
     224
     225        <ivp name="TestAdExBurst">
     226          <timestep>1e-3</timestep>
     227          <duration>300.0</duration>
     228        </ivp>
     229
     230    </Component>
     231
    114232</NineML>
  • release/4/9ML-toolkit/trunk/examples/LIF_UL.xml

    r30917 r30927  
    6060          <Initial>
    6161            <label>Isyn</label>
    62             <value>0.0</value>
     62            <value>1.0</value>
    6363          </Initial>
    6464
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.