Changeset 11997 in project


Ignore:
Timestamp:
09/25/08 10:04:25 (12 years ago)
Author:
Ivan Raikov
Message:

Now using all channels in the AKP example.

Location:
release/3/nemo/trunk/examples/AKP06
Files:
2 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • release/3/nemo/trunk/examples/AKP06/PotIhCa.scm

    r11996 r11997  
    157157                        ) ;; end Ih current
    158158
    159 ;;           (component (type ion-channel) (name CaP)
    160                        
    161 ;;                      (component (type gate)
    162                                    
    163 ;;                                 ;; rate functions
    164 ;;                                 (defun CaP_inf (v) 
    165 ;;                                   (let ((cv  19)
    166 ;;                                         (ck  5.5))
    167 ;;                                     (/ 1.0 (+ 1.0 (exp (neg (/ (+ v cv) ck)))))))
    168                                    
    169 ;;                                 (defun CaP_tau (v) 
    170 ;;                                   (if (> v -50)
    171 ;;                                       (* 1e3 (+ 0.000191 (* 0.00376 (pow (exp (neg (/ (+ v 41.9) 27.8)))  2))))
    172 ;;                                       (* 1e3 (+ 0.00026367 (* 0.1278 (exp (* 0.10327 v)))))))
    173 
    174 ;;                                 (hh-ionic-conductance
    175 ;;                                  (CaP  ;; ion name: exported variables will be of the form {ion}_{id}
    176 ;;                                   (initial-m  (CaP_inf Vrest))
    177 ;;                                   (m-power    1)
    178 ;;                                   (h-power    0)
    179 ;;                                   (m-inf      (CaP_inf v))
    180 ;;                                   (m-tau      (/ (CaP_tau v) temp_adj))))
    181                                    
    182 ;;                                 )
    183 
    184 ;;                      (component (type pore)
    185 ;;                                 (const gmax_CaP  = 0.01667)
    186 ;;                                 (gbar_CaP = (* gmax_CaP (ghk v celsius cai cao)))
    187 ;;                                 (output gbar_CaP ))
    188                        
    189 ;;                      (component (type accumulating-substance) (name ca) )
    190                        
    191                        
    192 ;;                      ) ;; end CaP current
     159             (component (type ion-channel) (name CaP)
     160                       
     161                        (component (type gate)
     162                                   
     163                                   ;; rate functions
     164                                   (defun CaP_inf (v) 
     165                                     (let ((cv  19)  (ck  5.5))
     166                                       (/ 1.0 (+ 1.0 (exp (neg (/ (+ v cv) ck)))))))
     167                                   
     168                                   (defun CaP_tau (v) 
     169                                     (if (> v -50)
     170                                         (* 1e3 (+ 0.000191 (* 0.00376 (pow (exp (neg (/ (+ v 41.9) 27.8)))  2))))
     171                                         (* 1e3 (+ 0.00026367 (* 0.1278 (exp (* 0.10327 v)))))))
     172
     173                                   (hh-ionic-conductance
     174                                    (CaP  ;; ion name: exported variables will be of the form {ion}_{id}
     175                                     (initial-m  (CaP_inf Vrest))
     176                                     (m-power    1)
     177                                     (h-power    0)
     178                                     (m-inf      (CaP_inf v))
     179                                     (m-tau      (/ (CaP_tau v) temp_adj))))
     180                                   
     181                                   )
     182
     183                        (component (type pore)
     184                                   (const gmax_CaP  = 0.01667)
     185                                   (gbar_CaP = (* gmax_CaP (ghk v celsius cai cao)))
     186                                   (output gbar_CaP ))
     187                       
     188                        (component (type accumulating-substance) (name ca) )
     189                       
     190                       
     191                        ) ;; end CaP current
    193192
    194193             
  • release/3/nemo/trunk/examples/AKP06/morphology_mechanisms.hoc

    r11996 r11997  
    1616//insert CaBK
    1717insert Caint
    18 insert CaP
     18//insert CaP
    1919//insert Ih
    2020insert leak
     
    3737//soma.gkbar_CaBK = 0.014
    3838soma.gbar_CaBK_PotIhCa = 0.014
    39 soma.pcabar_CaP = 0.00006
    40 //soma.gmax_CaP_PotIhCa = 0.06
     39//soma.pcabar_CaP = 0.00006
     40soma.gmax_CaP_PotIhCa = 0.06
    4141//soma.ghbar_Ih = 0.0002
    4242soma.gbar_Ih_PotIhCa = 0.0002
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.