| 1 | (ncml:model |
|---|
| 2 | (@ (name PotIhCa)) |
|---|
| 3 | (ncml:input (@ (id v)) (as v)) |
|---|
| 4 | (ncml:input (@ (id cai)) (as cai)) |
|---|
| 5 | (ncml:input (@ (id cao)) (as cao)) |
|---|
| 6 | (ncml:const (@ (id Vrest)) (ncml:expr -68.0)) |
|---|
| 7 | (ncml:const (@ (id diam)) (ncml:expr 20.0)) |
|---|
| 8 | (ncml:const (@ (id celsius)) (ncml:expr 24.0)) |
|---|
| 9 | (ncml:const (@ (id temp_adj)) (ncml:expr 1.24573093961552)) |
|---|
| 10 | (ncml:defun |
|---|
| 11 | (@ (id ghk)) |
|---|
| 12 | (ncml:arg v) |
|---|
| 13 | (ncml:arg celsius) |
|---|
| 14 | (ncml:arg ci) |
|---|
| 15 | (ncml:arg co) |
|---|
| 16 | (ncml:body |
|---|
| 17 | (ncml:let |
|---|
| 18 | (ncml:bnds |
|---|
| 19 | (ncml:bnd (@ (id F)) (ncml:expr 96485.0)) |
|---|
| 20 | (ncml:bnd (@ (id R)) (ncml:expr 8.3145))) |
|---|
| 21 | (ncml:expr |
|---|
| 22 | (ncml:let |
|---|
| 23 | (ncml:bnds |
|---|
| 24 | (ncml:bnd |
|---|
| 25 | (@ (id zeta)) |
|---|
| 26 | (ncml:expr |
|---|
| 27 | (ncml:div |
|---|
| 28 | (ncml:mul (ncml:mul 0.002 (ncml:id F)) (ncml:id v)) |
|---|
| 29 | (ncml:mul |
|---|
| 30 | (ncml:id R) |
|---|
| 31 | (ncml:sum 273.19 (ncml:id celsius))))))) |
|---|
| 32 | (ncml:expr |
|---|
| 33 | (ncml:apply |
|---|
| 34 | (@ (id if)) |
|---|
| 35 | (ncml:lt |
|---|
| 36 | (ncml:abs |
|---|
| 37 | (ncml:sum |
|---|
| 38 | 1.0 |
|---|
| 39 | (ncml:neg (ncml:exp (ncml:neg (ncml:id zeta)))))) |
|---|
| 40 | 1e-06) |
|---|
| 41 | (ncml:mul |
|---|
| 42 | (ncml:mul 1e-06 (ncml:mul 2.0 (ncml:id F))) |
|---|
| 43 | (ncml:mul |
|---|
| 44 | (ncml:sum |
|---|
| 45 | (ncml:id ci) |
|---|
| 46 | (ncml:neg |
|---|
| 47 | (ncml:mul |
|---|
| 48 | (ncml:id co) |
|---|
| 49 | (ncml:exp (ncml:neg (ncml:id zeta)))))) |
|---|
| 50 | (ncml:sum 1.0 (ncml:div (ncml:id zeta) 2.0)))) |
|---|
| 51 | (ncml:div |
|---|
| 52 | (ncml:mul |
|---|
| 53 | (ncml:mul |
|---|
| 54 | 1e-06 |
|---|
| 55 | (ncml:mul (ncml:mul 2.0 (ncml:id zeta)) (ncml:id F))) |
|---|
| 56 | (ncml:sum |
|---|
| 57 | (ncml:id ci) |
|---|
| 58 | (ncml:neg |
|---|
| 59 | (ncml:mul |
|---|
| 60 | (ncml:id co) |
|---|
| 61 | (ncml:exp (ncml:neg (ncml:id zeta))))))) |
|---|
| 62 | (ncml:sum |
|---|
| 63 | 1.0 |
|---|
| 64 | (ncml:neg (ncml:exp (ncml:neg (ncml:id zeta))))))))))))) |
|---|
| 65 | (ncml:component |
|---|
| 66 | (@ (name Kv1) (type ion-channel)) |
|---|
| 67 | (ncml:component |
|---|
| 68 | (@ (name comp0) (type gate)) |
|---|
| 69 | (ncml:defun |
|---|
| 70 | (@ (id Kv1_amf)) |
|---|
| 71 | (ncml:arg v) |
|---|
| 72 | (ncml:body |
|---|
| 73 | (ncml:let |
|---|
| 74 | (ncml:bnds |
|---|
| 75 | (ncml:bnd (@ (id cma)) (ncml:expr 0.12889)) |
|---|
| 76 | (ncml:bnd (@ (id cka)) (ncml:expr -33.90877)) |
|---|
| 77 | (ncml:bnd (@ (id cva)) (ncml:expr 45.0))) |
|---|
| 78 | (ncml:expr |
|---|
| 79 | (ncml:mul |
|---|
| 80 | (ncml:id cma) |
|---|
| 81 | (ncml:exp |
|---|
| 82 | (ncml:neg |
|---|
| 83 | (ncml:div |
|---|
| 84 | (ncml:sum (ncml:id v) (ncml:id cva)) |
|---|
| 85 | (ncml:id cka))))))))) |
|---|
| 86 | (ncml:defun |
|---|
| 87 | (@ (id Kv1_bmf)) |
|---|
| 88 | (ncml:arg v) |
|---|
| 89 | (ncml:body |
|---|
| 90 | (ncml:let |
|---|
| 91 | (ncml:bnds |
|---|
| 92 | (ncml:bnd (@ (id cmb)) (ncml:expr 0.12889)) |
|---|
| 93 | (ncml:bnd (@ (id ckb)) (ncml:expr 12.42101)) |
|---|
| 94 | (ncml:bnd (@ (id cvb)) (ncml:expr 45.0))) |
|---|
| 95 | (ncml:expr |
|---|
| 96 | (ncml:mul |
|---|
| 97 | (ncml:id cmb) |
|---|
| 98 | (ncml:exp |
|---|
| 99 | (ncml:neg |
|---|
| 100 | (ncml:div |
|---|
| 101 | (ncml:sum (ncml:id v) (ncml:id cvb)) |
|---|
| 102 | (ncml:id ckb))))))))) |
|---|
| 103 | (ncml:state_complex |
|---|
| 104 | (@ (id Kv1_m)) |
|---|
| 105 | (ncml:open Kv1_mO) |
|---|
| 106 | (ncml:initial 0.0737822020422147) |
|---|
| 107 | (ncml:transitions |
|---|
| 108 | (ncml:transition |
|---|
| 109 | (@ (src Kv1_mC) (dst Kv1_mO)) |
|---|
| 110 | (ncml:rate |
|---|
| 111 | (ncml:mul |
|---|
| 112 | (ncml:id temp_adj) |
|---|
| 113 | (ncml:apply (@ (id Kv1_amf)) (ncml:id v))))) |
|---|
| 114 | (ncml:transition |
|---|
| 115 | (@ (src Kv1_mO) (dst Kv1_mC)) |
|---|
| 116 | (ncml:rate |
|---|
| 117 | (ncml:mul |
|---|
| 118 | (ncml:id temp_adj) |
|---|
| 119 | (ncml:apply (@ (id Kv1_bmf)) (ncml:id v)))))) |
|---|
| 120 | (ncml:power 4.0)) |
|---|
| 121 | (ncml:output (@ (id Kv1_m)))) |
|---|
| 122 | (ncml:component |
|---|
| 123 | (@ (name comp1) (type pore)) |
|---|
| 124 | (ncml:const (@ (id gbar_Kv1)) (ncml:expr 0.011)) |
|---|
| 125 | (ncml:output (@ (id gbar_Kv1)))) |
|---|
| 126 | (ncml:component |
|---|
| 127 | (@ (name k) (type permeating-substance)) |
|---|
| 128 | (ncml:const (@ (id e_Kv1)) (ncml:expr -85.0)) |
|---|
| 129 | (ncml:output (@ (id e_Kv1))))) |
|---|
| 130 | (ncml:component |
|---|
| 131 | (@ (name Kv4) (type ion-channel)) |
|---|
| 132 | (ncml:component |
|---|
| 133 | (@ (name comp4) (type gate)) |
|---|
| 134 | (ncml:defun |
|---|
| 135 | (@ (id Kv4_amf)) |
|---|
| 136 | (ncml:arg v) |
|---|
| 137 | (ncml:body |
|---|
| 138 | (ncml:let |
|---|
| 139 | (ncml:bnds |
|---|
| 140 | (ncml:bnd (@ (id can)) (ncml:expr 0.15743)) |
|---|
| 141 | (ncml:bnd (@ (id ckan)) (ncml:expr -32.19976)) |
|---|
| 142 | (ncml:bnd (@ (id cvan)) (ncml:expr 57.0))) |
|---|
| 143 | (ncml:expr |
|---|
| 144 | (ncml:mul |
|---|
| 145 | (ncml:id can) |
|---|
| 146 | (ncml:exp |
|---|
| 147 | (ncml:neg |
|---|
| 148 | (ncml:div |
|---|
| 149 | (ncml:sum (ncml:id v) (ncml:id cvan)) |
|---|
| 150 | (ncml:id ckan))))))))) |
|---|
| 151 | (ncml:defun |
|---|
| 152 | (@ (id Kv4_bmf)) |
|---|
| 153 | (ncml:arg v) |
|---|
| 154 | (ncml:body |
|---|
| 155 | (ncml:let |
|---|
| 156 | (ncml:bnds |
|---|
| 157 | (ncml:bnd (@ (id cbn)) (ncml:expr 0.15743)) |
|---|
| 158 | (ncml:bnd (@ (id ckbn)) (ncml:expr 37.51346)) |
|---|
| 159 | (ncml:bnd (@ (id cvbn)) (ncml:expr 57.0))) |
|---|
| 160 | (ncml:expr |
|---|
| 161 | (ncml:mul |
|---|
| 162 | (ncml:id cbn) |
|---|
| 163 | (ncml:exp |
|---|
| 164 | (ncml:neg |
|---|
| 165 | (ncml:div |
|---|
| 166 | (ncml:sum (ncml:id v) (ncml:id cvbn)) |
|---|
| 167 | (ncml:id ckbn))))))))) |
|---|
| 168 | (ncml:defun |
|---|
| 169 | (@ (id Kv4_ahf)) |
|---|
| 170 | (ncml:arg v) |
|---|
| 171 | (ncml:body |
|---|
| 172 | (ncml:let |
|---|
| 173 | (ncml:bnds |
|---|
| 174 | (ncml:bnd (@ (id cah)) (ncml:expr 0.01342)) |
|---|
| 175 | (ncml:bnd (@ (id ckah)) (ncml:expr -7.86476)) |
|---|
| 176 | (ncml:bnd (@ (id cvah)) (ncml:expr 60.0))) |
|---|
| 177 | (ncml:expr |
|---|
| 178 | (ncml:div |
|---|
| 179 | (ncml:id cah) |
|---|
| 180 | (ncml:sum |
|---|
| 181 | 1.0 |
|---|
| 182 | (ncml:exp |
|---|
| 183 | (ncml:neg |
|---|
| 184 | (ncml:div |
|---|
| 185 | (ncml:sum (ncml:id v) (ncml:id cvah)) |
|---|
| 186 | (ncml:id ckah)))))))))) |
|---|
| 187 | (ncml:defun |
|---|
| 188 | (@ (id Kv4_bhf)) |
|---|
| 189 | (ncml:arg v) |
|---|
| 190 | (ncml:body |
|---|
| 191 | (ncml:let |
|---|
| 192 | (ncml:bnds |
|---|
| 193 | (ncml:bnd (@ (id cbh)) (ncml:expr 0.04477)) |
|---|
| 194 | (ncml:bnd (@ (id ckbh)) (ncml:expr 11.3615)) |
|---|
| 195 | (ncml:bnd (@ (id cvbh)) (ncml:expr 54.0))) |
|---|
| 196 | (ncml:expr |
|---|
| 197 | (ncml:div |
|---|
| 198 | (ncml:id cbh) |
|---|
| 199 | (ncml:sum |
|---|
| 200 | 1.0 |
|---|
| 201 | (ncml:exp |
|---|
| 202 | (ncml:neg |
|---|
| 203 | (ncml:div |
|---|
| 204 | (ncml:sum (ncml:id v) (ncml:id cvbh)) |
|---|
| 205 | (ncml:id ckbh)))))))))) |
|---|
| 206 | (ncml:state_complex |
|---|
| 207 | (@ (id Kv4_m)) |
|---|
| 208 | (ncml:open Kv4_mO) |
|---|
| 209 | (ncml:initial 0.34641264037007) |
|---|
| 210 | (ncml:transitions |
|---|
| 211 | (ncml:transition |
|---|
| 212 | (@ (src Kv4_mC) (dst Kv4_mO)) |
|---|
| 213 | (ncml:rate |
|---|
| 214 | (ncml:mul |
|---|
| 215 | (ncml:id temp_adj) |
|---|
| 216 | (ncml:apply (@ (id Kv4_amf)) (ncml:id v))))) |
|---|
| 217 | (ncml:transition |
|---|
| 218 | (@ (src Kv4_mO) (dst Kv4_mC)) |
|---|
| 219 | (ncml:rate |
|---|
| 220 | (ncml:mul |
|---|
| 221 | (ncml:id temp_adj) |
|---|
| 222 | (ncml:apply (@ (id Kv4_bmf)) (ncml:id v)))))) |
|---|
| 223 | (ncml:power 4.0)) |
|---|
| 224 | (ncml:state_complex |
|---|
| 225 | (@ (id Kv4_h)) |
|---|
| 226 | (ncml:open Kv4_hO) |
|---|
| 227 | (ncml:initial 0.493672083654485) |
|---|
| 228 | (ncml:transitions |
|---|
| 229 | (ncml:transition |
|---|
| 230 | (@ (src Kv4_hC) (dst Kv4_hO)) |
|---|
| 231 | (ncml:rate |
|---|
| 232 | (ncml:mul |
|---|
| 233 | (ncml:id temp_adj) |
|---|
| 234 | (ncml:apply (@ (id Kv4_ahf)) (ncml:id v))))) |
|---|
| 235 | (ncml:transition |
|---|
| 236 | (@ (src Kv4_hO) (dst Kv4_hC)) |
|---|
| 237 | (ncml:rate |
|---|
| 238 | (ncml:mul |
|---|
| 239 | (ncml:id temp_adj) |
|---|
| 240 | (ncml:apply (@ (id Kv4_bhf)) (ncml:id v)))))) |
|---|
| 241 | (ncml:power 1.0)) |
|---|
| 242 | (ncml:output (@ (id Kv4_m))) |
|---|
| 243 | (ncml:output (@ (id Kv4_h)))) |
|---|
| 244 | (ncml:component |
|---|
| 245 | (@ (name comp5) (type pore)) |
|---|
| 246 | (ncml:const (@ (id gbar_Kv4)) (ncml:expr 0.0039)) |
|---|
| 247 | (ncml:output (@ (id gbar_Kv4)))) |
|---|
| 248 | (ncml:component |
|---|
| 249 | (@ (name k) (type permeating-substance)) |
|---|
| 250 | (ncml:const (@ (id e_Kv4)) (ncml:expr -85.0)) |
|---|
| 251 | (ncml:output (@ (id e_Kv4))))) |
|---|
| 252 | (ncml:component |
|---|
| 253 | (@ (name Ih) (type ion-channel)) |
|---|
| 254 | (ncml:component |
|---|
| 255 | (@ (name comp8) (type gate)) |
|---|
| 256 | (ncml:defun |
|---|
| 257 | (@ (id Ih_inf)) |
|---|
| 258 | (ncml:arg v) |
|---|
| 259 | (ncml:body |
|---|
| 260 | (ncml:let |
|---|
| 261 | (ncml:bnds |
|---|
| 262 | (ncml:bnd (@ (id cvn)) (ncml:expr 90.1)) |
|---|
| 263 | (ncml:bnd (@ (id ckn)) (ncml:expr -9.9))) |
|---|
| 264 | (ncml:expr |
|---|
| 265 | (ncml:div |
|---|
| 266 | 1.0 |
|---|
| 267 | (ncml:sum |
|---|
| 268 | 1.0 |
|---|
| 269 | (ncml:exp |
|---|
| 270 | (ncml:neg |
|---|
| 271 | (ncml:div |
|---|
| 272 | (ncml:sum (ncml:id v) (ncml:id cvn)) |
|---|
| 273 | (ncml:id ckn)))))))))) |
|---|
| 274 | (ncml:defun |
|---|
| 275 | (@ (id Ih_tau)) |
|---|
| 276 | (ncml:arg v) |
|---|
| 277 | (ncml:body |
|---|
| 278 | (ncml:let |
|---|
| 279 | (ncml:bnds |
|---|
| 280 | (ncml:bnd (@ (id cct)) (ncml:expr 190.0)) |
|---|
| 281 | (ncml:bnd (@ (id cat)) (ncml:expr 720.0)) |
|---|
| 282 | (ncml:bnd (@ (id cvt)) (ncml:expr 81.5)) |
|---|
| 283 | (ncml:bnd (@ (id ckt)) (ncml:expr 11.9))) |
|---|
| 284 | (ncml:expr |
|---|
| 285 | (ncml:sum |
|---|
| 286 | (ncml:id cct) |
|---|
| 287 | (ncml:mul |
|---|
| 288 | (ncml:id cat) |
|---|
| 289 | (ncml:exp |
|---|
| 290 | (ncml:neg |
|---|
| 291 | (ncml:pow |
|---|
| 292 | (ncml:div |
|---|
| 293 | (ncml:sum (ncml:id v) (ncml:id cvt)) |
|---|
| 294 | (ncml:id ckt)) |
|---|
| 295 | 2.0))))))))) |
|---|
| 296 | (ncml:state_complex |
|---|
| 297 | (@ (id Ih_m)) |
|---|
| 298 | (ncml:open Ih_mO) |
|---|
| 299 | (ncml:initial 0.0968851713304939) |
|---|
| 300 | (ncml:transitions |
|---|
| 301 | (ncml:transition |
|---|
| 302 | (@ (src Ih_mC) (dst Ih_mO)) |
|---|
| 303 | (ncml:rate (ncml:div (ncml:id Ih_m-inf) (ncml:id Ih_m-tau)))) |
|---|
| 304 | (ncml:transition |
|---|
| 305 | (@ (src Ih_mO) (dst Ih_mC)) |
|---|
| 306 | (ncml:rate |
|---|
| 307 | (ncml:div |
|---|
| 308 | (ncml:sum 1.0 (ncml:neg (ncml:id Ih_m-inf))) |
|---|
| 309 | (ncml:id Ih_m-tau))))) |
|---|
| 310 | (ncml:power 1.0)) |
|---|
| 311 | (ncml:asgn |
|---|
| 312 | (@ (id Ih_m-inf)) |
|---|
| 313 | (ncml:expr (ncml:apply (@ (id Ih_inf)) (ncml:id v)))) |
|---|
| 314 | (ncml:asgn |
|---|
| 315 | (@ (id Ih_m-tau)) |
|---|
| 316 | (ncml:expr |
|---|
| 317 | (ncml:div |
|---|
| 318 | (ncml:apply (@ (id Ih_tau)) (ncml:id v)) |
|---|
| 319 | (ncml:id temp_adj)))) |
|---|
| 320 | (ncml:output (@ (id Ih_m)))) |
|---|
| 321 | (ncml:component |
|---|
| 322 | (@ (name comp9) (type pore)) |
|---|
| 323 | (ncml:const (@ (id gbar_Ih)) (ncml:expr 0.0002)) |
|---|
| 324 | (ncml:output (@ (id gbar_Ih)))) |
|---|
| 325 | (ncml:component |
|---|
| 326 | (@ (name non-specific) (type permeating-substance)) |
|---|
| 327 | (ncml:const (@ (id e_Ih)) (ncml:expr -30.0)) |
|---|
| 328 | (ncml:output (@ (id e_Ih))))) |
|---|
| 329 | (ncml:component |
|---|
| 330 | (@ (name CaP) (type ion-channel)) |
|---|
| 331 | (ncml:component |
|---|
| 332 | (@ (name comp12) (type gate)) |
|---|
| 333 | (ncml:defun |
|---|
| 334 | (@ (id CaP_inf)) |
|---|
| 335 | (ncml:arg v) |
|---|
| 336 | (ncml:body |
|---|
| 337 | (ncml:let |
|---|
| 338 | (ncml:bnds |
|---|
| 339 | (ncml:bnd (@ (id cv)) (ncml:expr 19.0)) |
|---|
| 340 | (ncml:bnd (@ (id ck)) (ncml:expr 5.5))) |
|---|
| 341 | (ncml:expr |
|---|
| 342 | (ncml:div |
|---|
| 343 | 1.0 |
|---|
| 344 | (ncml:sum |
|---|
| 345 | 1.0 |
|---|
| 346 | (ncml:exp |
|---|
| 347 | (ncml:neg |
|---|
| 348 | (ncml:div |
|---|
| 349 | (ncml:sum (ncml:id v) (ncml:id cv)) |
|---|
| 350 | (ncml:id ck)))))))))) |
|---|
| 351 | (ncml:defun |
|---|
| 352 | (@ (id CaP_tau)) |
|---|
| 353 | (ncml:arg v) |
|---|
| 354 | (ncml:body |
|---|
| 355 | (ncml:apply |
|---|
| 356 | (@ (id if)) |
|---|
| 357 | (ncml:gt (ncml:id v) -50.0) |
|---|
| 358 | (ncml:mul |
|---|
| 359 | 1000.0 |
|---|
| 360 | (ncml:sum |
|---|
| 361 | 0.000191 |
|---|
| 362 | (ncml:mul |
|---|
| 363 | 0.00376 |
|---|
| 364 | (ncml:pow |
|---|
| 365 | (ncml:exp |
|---|
| 366 | (ncml:neg (ncml:div (ncml:sum (ncml:id v) 41.9) 27.8))) |
|---|
| 367 | 2.0)))) |
|---|
| 368 | (ncml:mul |
|---|
| 369 | 1000.0 |
|---|
| 370 | (ncml:sum |
|---|
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|---|
| 372 | (ncml:mul |
|---|
| 373 | 0.1278 |
|---|
| 374 | (ncml:exp (ncml:mul 0.10327 (ncml:id v))))))))) |
|---|
| 375 | (ncml:state_complex |
|---|
| 376 | (@ (id CaP_m)) |
|---|
| 377 | (ncml:open CaP_mO) |
|---|
| 378 | (ncml:initial 0.000135136381706817) |
|---|
| 379 | (ncml:transitions |
|---|
| 380 | (ncml:transition |
|---|
| 381 | (@ (src CaP_mC) (dst CaP_mO)) |
|---|
| 382 | (ncml:rate (ncml:div (ncml:id CaP_m-inf) (ncml:id CaP_m-tau)))) |
|---|
| 383 | (ncml:transition |
|---|
| 384 | (@ (src CaP_mO) (dst CaP_mC)) |
|---|
| 385 | (ncml:rate |
|---|
| 386 | (ncml:div |
|---|
| 387 | (ncml:sum 1.0 (ncml:neg (ncml:id CaP_m-inf))) |
|---|
| 388 | (ncml:id CaP_m-tau))))) |
|---|
| 389 | (ncml:power 1.0)) |
|---|
| 390 | (ncml:asgn |
|---|
| 391 | (@ (id CaP_m-inf)) |
|---|
| 392 | (ncml:expr (ncml:apply (@ (id CaP_inf)) (ncml:id v)))) |
|---|
| 393 | (ncml:asgn |
|---|
| 394 | (@ (id CaP_m-tau)) |
|---|
| 395 | (ncml:expr |
|---|
| 396 | (ncml:div |
|---|
| 397 | (ncml:apply (@ (id CaP_tau)) (ncml:id v)) |
|---|
| 398 | (ncml:id temp_adj)))) |
|---|
| 399 | (ncml:output (@ (id CaP_m)))) |
|---|
| 400 | (ncml:component |
|---|
| 401 | (@ (name comp13) (type pore)) |
|---|
| 402 | (ncml:const (@ (id gmax_CaP)) (ncml:expr 0.01667)) |
|---|
| 403 | (ncml:asgn |
|---|
| 404 | (@ (id gbar_CaP)) |
|---|
| 405 | (ncml:expr |
|---|
| 406 | (ncml:mul |
|---|
| 407 | (ncml:id gmax_CaP) |
|---|
| 408 | (ncml:apply |
|---|
| 409 | (@ (id ghk)) |
|---|
| 410 | (ncml:id v) |
|---|
| 411 | (ncml:id celsius) |
|---|
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|---|
| 413 | (ncml:id cao))))) |
|---|
| 414 | (ncml:output (@ (id gbar_CaP)))) |
|---|
| 415 | (ncml:component (@ (name ca) (type accumulating-substance)))) |
|---|
| 416 | (ncml:component |
|---|
| 417 | (@ (name CaBK) (type ion-channel)) |
|---|
| 418 | (ncml:component |
|---|
| 419 | (@ (name comp16) (type gate)) |
|---|
| 420 | (ncml:defun |
|---|
| 421 | (@ (id CaBK_zinf)) |
|---|
| 422 | (ncml:arg ca) |
|---|
| 423 | (ncml:body |
|---|
| 424 | (ncml:let |
|---|
| 425 | (ncml:bnds (ncml:bnd (@ (id zhalf)) (ncml:expr 0.001))) |
|---|
| 426 | (ncml:expr |
|---|
| 427 | (ncml:div |
|---|
| 428 | 1.0 |
|---|
| 429 | (ncml:sum 1.0 (ncml:div (ncml:id zhalf) (ncml:id ca)))))))) |
|---|
| 430 | (ncml:const (@ (id CaBK_ztau)) (ncml:expr 1.0)) |
|---|
| 431 | (ncml:defun |
|---|
| 432 | (@ (id CaBK_minf)) |
|---|
| 433 | (ncml:arg v) |
|---|
| 434 | (ncml:body |
|---|
| 435 | (ncml:let |
|---|
| 436 | (ncml:bnds |
|---|
| 437 | (ncml:bnd (@ (id cvm)) (ncml:expr 28.9)) |
|---|
| 438 | (ncml:bnd (@ (id ckm)) (ncml:expr 6.2))) |
|---|
| 439 | (ncml:expr |
|---|
| 440 | (ncml:div |
|---|
| 441 | 1.0 |
|---|
| 442 | (ncml:sum |
|---|
| 443 | 1.0 |
|---|
| 444 | (ncml:exp |
|---|
| 445 | (ncml:neg |
|---|
| 446 | (ncml:div |
|---|
| 447 | (ncml:sum (ncml:sum (ncml:id v) 5.0) (ncml:id cvm)) |
|---|
| 448 | (ncml:id ckm)))))))))) |
|---|
| 449 | (ncml:defun |
|---|
| 450 | (@ (id CaBK_mtau)) |
|---|
| 451 | (ncml:arg v) |
|---|
| 452 | (ncml:body |
|---|
| 453 | (ncml:let |
|---|
| 454 | (ncml:bnds |
|---|
| 455 | (ncml:bnd (@ (id ctm)) (ncml:expr 0.000505)) |
|---|
| 456 | (ncml:bnd (@ (id cvtm1)) (ncml:expr 86.4)) |
|---|
| 457 | (ncml:bnd (@ (id cktm1)) (ncml:expr -10.1)) |
|---|
| 458 | (ncml:bnd (@ (id cvtm2)) (ncml:expr -33.3)) |
|---|
| 459 | (ncml:bnd (@ (id cktm2)) (ncml:expr 10.0))) |
|---|
| 460 | (ncml:expr |
|---|
| 461 | (ncml:sum |
|---|
| 462 | (ncml:id ctm) |
|---|
| 463 | (ncml:div |
|---|
| 464 | 1.0 |
|---|
| 465 | (ncml:sum |
|---|
| 466 | (ncml:exp |
|---|
| 467 | (ncml:neg |
|---|
| 468 | (ncml:div |
|---|
| 469 | (ncml:sum (ncml:sum (ncml:id v) 5.0) (ncml:id cvtm1)) |
|---|
| 470 | (ncml:id cktm1)))) |
|---|
| 471 | (ncml:exp |
|---|
| 472 | (ncml:neg |
|---|
| 473 | (ncml:div |
|---|
| 474 | (ncml:sum (ncml:sum (ncml:id v) 5.0) (ncml:id cvtm2)) |
|---|
| 475 | (ncml:id cktm2))))))))))) |
|---|
| 476 | (ncml:defun |
|---|
| 477 | (@ (id CaBK_hinf)) |
|---|
| 478 | (ncml:arg v) |
|---|
| 479 | (ncml:body |
|---|
| 480 | (ncml:let |
|---|
| 481 | (ncml:bnds |
|---|
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|---|
| 483 | (ncml:bnd (@ (id cvh)) (ncml:expr 32.0)) |
|---|
| 484 | (ncml:bnd (@ (id ckh)) (ncml:expr -5.8))) |
|---|
| 485 | (ncml:expr |
|---|
| 486 | (ncml:sum |
|---|
| 487 | (ncml:id ch) |
|---|
| 488 | (ncml:div |
|---|
| 489 | (ncml:sum 1.0 (ncml:neg (ncml:id ch))) |
|---|
| 490 | (ncml:sum |
|---|
| 491 | 1.0 |
|---|
| 492 | (ncml:exp |
|---|
| 493 | (ncml:neg |
|---|
| 494 | (ncml:div |
|---|
| 495 | (ncml:sum (ncml:sum (ncml:id v) 5.0) (ncml:id cvh)) |
|---|
| 496 | (ncml:id ckh))))))))))) |
|---|
| 497 | (ncml:defun |
|---|
| 498 | (@ (id CaBK_htau)) |
|---|
| 499 | (ncml:arg v) |
|---|
| 500 | (ncml:body |
|---|
| 501 | (ncml:let |
|---|
| 502 | (ncml:bnds |
|---|
| 503 | (ncml:bnd (@ (id cth)) (ncml:expr 0.0019)) |
|---|
| 504 | (ncml:bnd (@ (id cvth1)) (ncml:expr 48.5)) |
|---|
| 505 | (ncml:bnd (@ (id ckth1)) (ncml:expr -5.2)) |
|---|
| 506 | (ncml:bnd (@ (id cvth2)) (ncml:expr -54.2)) |
|---|
| 507 | (ncml:bnd (@ (id ckth2)) (ncml:expr 12.9))) |
|---|
| 508 | (ncml:expr |
|---|
| 509 | (ncml:sum |
|---|
| 510 | (ncml:id cth) |
|---|
| 511 | (ncml:div |
|---|
| 512 | 1.0 |
|---|
| 513 | (ncml:sum |
|---|
| 514 | (ncml:exp |
|---|
| 515 | (ncml:div |
|---|
| 516 | (ncml:sum (ncml:id v) (ncml:id cvth1)) |
|---|
| 517 | (ncml:id ckth1))) |
|---|
| 518 | (ncml:exp |
|---|
| 519 | (ncml:div |
|---|
| 520 | (ncml:sum (ncml:id v) (ncml:id cvth2)) |
|---|
| 521 | (ncml:id ckth2)))))))))) |
|---|
| 522 | (ncml:state_complex |
|---|
| 523 | (@ (id CaBK_z)) |
|---|
| 524 | (ncml:open zO) |
|---|
| 525 | (ncml:initial 0.0909090909090909) |
|---|
| 526 | (ncml:transitions |
|---|
| 527 | (ncml:transition |
|---|
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|---|
| 529 | (ncml:rate |
|---|
| 530 | (ncml:div |
|---|
| 531 | (ncml:apply (@ (id CaBK_zinf)) (ncml:id cai)) |
|---|
| 532 | (ncml:id CaBK_ztau)))) |
|---|
| 533 | (ncml:transition |
|---|
| 534 | (@ (src zO) (dst zC)) |
|---|
| 535 | (ncml:rate |
|---|
| 536 | (ncml:div |
|---|
| 537 | (ncml:sum |
|---|
| 538 | 1.0 |
|---|
| 539 | (ncml:neg (ncml:apply (@ (id CaBK_zinf)) (ncml:id cai)))) |
|---|
| 540 | (ncml:id CaBK_ztau))))) |
|---|
| 541 | (ncml:power 2.0)) |
|---|
| 542 | (ncml:state_complex |
|---|
| 543 | (@ (id CaBK_m)) |
|---|
| 544 | (ncml:open CaBK_mO) |
|---|
| 545 | (ncml:initial 0.00326726870663768) |
|---|
| 546 | (ncml:transitions |
|---|
| 547 | (ncml:transition |
|---|
| 548 | (@ (src CaBK_mC) (dst CaBK_mO)) |
|---|
| 549 | (ncml:rate (ncml:div (ncml:id CaBK_m-inf) (ncml:id CaBK_m-tau)))) |
|---|
| 550 | (ncml:transition |
|---|
| 551 | (@ (src CaBK_mO) (dst CaBK_mC)) |
|---|
| 552 | (ncml:rate |
|---|
| 553 | (ncml:div |
|---|
| 554 | (ncml:sum 1.0 (ncml:neg (ncml:id CaBK_m-inf))) |
|---|
| 555 | (ncml:id CaBK_m-tau))))) |
|---|
| 556 | (ncml:power 3.0)) |
|---|
| 557 | (ncml:asgn |
|---|
| 558 | (@ (id CaBK_m-inf)) |
|---|
| 559 | (ncml:expr |
|---|
| 560 | (ncml:div |
|---|
| 561 | (ncml:apply (@ (id CaBK_minf)) (ncml:id v)) |
|---|
| 562 | (ncml:id temp_adj)))) |
|---|
| 563 | (ncml:asgn |
|---|
| 564 | (@ (id CaBK_m-tau)) |
|---|
| 565 | (ncml:expr |
|---|
| 566 | (ncml:div |
|---|
| 567 | (ncml:apply (@ (id CaBK_mtau)) (ncml:id v)) |
|---|
| 568 | (ncml:id temp_adj)))) |
|---|
| 569 | (ncml:state_complex |
|---|
| 570 | (@ (id CaBK_h)) |
|---|
| 571 | (ncml:open CaBK_hO) |
|---|
| 572 | (ncml:initial 0.799252570696669) |
|---|
| 573 | (ncml:transitions |
|---|
| 574 | (ncml:transition |
|---|
| 575 | (@ (src CaBK_hC) (dst CaBK_hO)) |
|---|
| 576 | (ncml:rate |
|---|
| 577 | (ncml:div |
|---|
| 578 | (ncml:div |
|---|
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|---|
| 580 | (ncml:id temp_adj)) |
|---|
| 581 | (ncml:div |
|---|
| 582 | (ncml:apply (@ (id CaBK_htau)) (ncml:id v)) |
|---|
| 583 | (ncml:id temp_adj))))) |
|---|
| 584 | (ncml:transition |
|---|
| 585 | (@ (src CaBK_hO) (dst CaBK_hC)) |
|---|
| 586 | (ncml:rate |
|---|
| 587 | (ncml:div |
|---|
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|---|
| 589 | 1.0 |
|---|
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|---|
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|---|
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|---|
| 593 | (ncml:id temp_adj)))) |
|---|
| 594 | (ncml:div |
|---|
| 595 | (ncml:apply (@ (id CaBK_htau)) (ncml:id v)) |
|---|
| 596 | (ncml:id temp_adj)))))) |
|---|
| 597 | (ncml:power 1.0)) |
|---|
| 598 | (ncml:output (@ (id CaBK_z))) |
|---|
| 599 | (ncml:output (@ (id CaBK_m))) |
|---|
| 600 | (ncml:output (@ (id CaBK_h)))) |
|---|
| 601 | (ncml:component |
|---|
| 602 | (@ (name comp17) (type pore)) |
|---|
| 603 | (ncml:const (@ (id gbar_CaBK)) (ncml:expr 0.014)) |
|---|
| 604 | (ncml:output (@ (id gbar_CaBK)))) |
|---|
| 605 | (ncml:component |
|---|
| 606 | (@ (name k) (type permeating-substance)) |
|---|
| 607 | (ncml:const (@ (id e_CaBK)) (ncml:expr -85.0)) |
|---|
| 608 | (ncml:output (@ (id e_CaBK)))))) |
|---|
